En aquellos pacientes que han tenido Colitis Ulcerosa durante más de 10 años, el riesgo de cáncer de colon es más alto de lo normal, con una incidencia del 5-10%. Dicho riesgo se eleva a 15-40% tras 30 años, dependiendo del estudio que se considere. Si sólo están afectados el recto y el sIgMa, el riesgo de cáncer no es significativamente más alto de lo normal. Los pacientes que muestran displasia, o cambios precancerosos en las células y que pueden ser detectados mediante una biopsia tienen un riesgo más alto.

El riesgo de cáncer de colon en los pacientes con Enfermedad de Crohn en el colon es ligeramente más alto que en el resto de la población.
Cualquier persona con un riesgo de cáncer por encima de la media debería realizarse colonoscopias y biopsias de forma regular, con el objeto de que el cáncer pueda ser detectado lo más pronto posible.